Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX5P35711 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX5P35711 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX5P35711 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX5P35711 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX5P35711 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX5P35711 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX5P35711 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX5P35711 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX5P35711 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX5P35711 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX5P35711 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX5P35711 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX5P35711 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX5P35711 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX5P35711 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX5P35711 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX5P35711 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX5P35711 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX5P35711 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX5P35711 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX5P35711 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX5P35711 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX5P35711 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX5P35711 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX5P35711 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX5P35711 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX5P35711 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX5P35711 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX5P35711 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX5P35711 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX5P35711 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX5P35711 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX5P35711 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX5P35711 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX5P35711 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX5P35711 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX5P35711 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX5P35711 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX5P35711 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX5P35711 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX5P35711 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX5P35711 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX5P35711 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX5P35711 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX5P35711 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX5P35711 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX5P35711 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX5P35711 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX5P35711 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX5P35711 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX5P35711 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX5P35711 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX5P35711 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX5P35711 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX5P35711 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX5P35711 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX5P35711 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX5P35711 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX5P35711 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms