Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H1P32780 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H1P32780 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H1P32780 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms