Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXD11P31277 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXD11P31277 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXD11P31277 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms