Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA11P31270 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HOXA11P31270 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HOXA11P31270 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms