Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRIP30626 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRIP30626 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRIP30626 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRIP30626 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRIP30626 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRIP30626 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SRIP30626 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRIP30626 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRIP30626 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRIP30626 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRIP30626 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRIP30626 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRIP30626 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRIP30626 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRIP30626 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRIP30626 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRIP30626 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRIP30626 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRIP30626 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRIP30626 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRIP30626 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRIP30626 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRIP30626 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRIP30626 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRIP30626 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRIP30626 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRIP30626 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRIP30626 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRIP30626 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRIP30626 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRIP30626 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRIP30626 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRIP30626 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRIP30626 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRIP30626 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRIP30626 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRIP30626 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRIP30626 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRIP30626 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRIP30626 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRIP30626 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRIP30626 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRIP30626 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRIP30626 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRIP30626 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRIP30626 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRIP30626 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRIP30626 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRIP30626 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRIP30626 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRIP30626 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRIP30626 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRIP30626 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRIP30626 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRIP30626 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRIP30626 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRIP30626 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRIP30626 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRIP30626 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms