Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HLA-FP30511 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HLA-FP30511 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms