Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCND3P30281 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCND3P30281 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCND3P30281 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCND3P30281 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCND3P30281 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCND3P30281 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND3P30281 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND3P30281 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND3P30281 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND3P30281 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND3P30281 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCND3P30281 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND3P30281 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND3P30281 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND3P30281 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND3P30281 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCND3P30281 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCND3P30281 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCND3P30281 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCND3P30281 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCND3P30281 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCND3P30281 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND3P30281 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND3P30281 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND3P30281 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND3P30281 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCND3P30281 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND3P30281 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND3P30281 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND3P30281 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND3P30281 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCND3P30281 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND3P30281 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND3P30281 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND3P30281 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND3P30281 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCND3P30281 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND3P30281 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND3P30281 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND3P30281 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND3P30281 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND3P30281 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND3P30281 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND3P30281 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND3P30281 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCND3P30281 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND3P30281 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND3P30281 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND3P30281 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND3P30281 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCND3P30281 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCND3P30281 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND3P30281 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND3P30281 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND3P30281 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND3P30281 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCND3P30281 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCND3P30281 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCND3P30281 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCND3P30281 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND3P30281 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND3P30281 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND3P30281 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND3P30281 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND3P30281 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCND3P30281 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND3P30281 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND3P30281 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND3P30281 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND3P30281 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND3P30281 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND3P30281 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND3P30281 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND3P30281 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCND3P30281 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND3P30281 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND3P30281 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND3P30281 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND3P30281 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND3P30281 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCND3P30281 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms