Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTSSP25774 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTSSP25774 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTSSP25774 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTSSP25774 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTSSP25774 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTSSP25774 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTSSP25774 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTSSP25774 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTSSP25774 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTSSP25774 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTSSP25774 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTSSP25774 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTSSP25774 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTSSP25774 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTSSP25774 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTSSP25774 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTSSP25774 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTSSP25774 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTSSP25774 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTSSP25774 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTSSP25774 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTSSP25774 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTSSP25774 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTSSP25774 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTSSP25774 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTSSP25774 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTSSP25774 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTSSP25774 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTSSP25774 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTSSP25774 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTSSP25774 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTSSP25774 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTSSP25774 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTSSP25774 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTSSP25774 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTSSP25774 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTSSP25774 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTSSP25774 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTSSP25774 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTSSP25774 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTSSP25774 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTSSP25774 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTSSP25774 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTSSP25774 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTSSP25774 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTSSP25774 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTSSP25774 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTSSP25774 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTSSP25774 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTSSP25774 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTSSP25774 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTSSP25774 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTSSP25774 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTSSP25774 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTSSP25774 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTSSP25774 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTSSP25774 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTSSP25774 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTSSP25774 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTSSP25774 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTSSP25774 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTSSP25774 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTSSP25774 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTSSP25774 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTSSP25774 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTSSP25774 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTSSP25774 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms