Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAX3P23760 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAX3P23760 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAX3P23760 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAX3P23760 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAX3P23760 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAX3P23760 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAX3P23760 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAX3P23760 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAX3P23760 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAX3P23760 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAX3P23760 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PAX3P23760 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAX3P23760 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAX3P23760 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAX3P23760 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAX3P23760 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAX3P23760 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAX3P23760 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAX3P23760 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAX3P23760 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAX3P23760 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAX3P23760 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX3P23760 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX3P23760 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX3P23760 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX3P23760 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX3P23760 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX3P23760 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX3P23760 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX3P23760 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAX3P23760 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAX3P23760 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAX3P23760 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAX3P23760 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAX3P23760 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAX3P23760 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAX3P23760 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAX3P23760 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAX3P23760 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAX3P23760 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAX3P23760 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAX3P23760 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAX3P23760 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAX3P23760 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAX3P23760 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAX3P23760 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PAX3P23760 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAX3P23760 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAX3P23760 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAX3P23760 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PAX3P23760 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX3P23760 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX3P23760 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX3P23760 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX3P23760 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX3P23760 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX3P23760 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX3P23760 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX3P23760 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PAX3P23760 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAX3P23760 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAX3P23760 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAX3P23760 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAX3P23760 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PAX3P23760 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PAX3P23760 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX3P23760 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX3P23760 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX3P23760 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX3P23760 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX3P23760 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX3P23760 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX3P23760 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAX3P23760 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PAX3P23760 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAX3P23760 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAX3P23760 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAX3P23760 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAX3P23760 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAX3P23760 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAX3P23760 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAX3P23760 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAX3P23760 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAX3P23760 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAX3P23760 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAX3P23760 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PAX3P23760 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX3P23760 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX3P23760 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX3P23760 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms