Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRZ1P23471 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRZ1P23471 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRZ1P23471 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms