Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBG1P23258 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBG1P23258 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms