Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCP2P22307 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCP2P22307 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCP2P22307 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCP2P22307 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCP2P22307 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCP2P22307 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCP2P22307 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCP2P22307 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCP2P22307 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCP2P22307 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCP2P22307 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCP2P22307 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCP2P22307 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCP2P22307 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCP2P22307 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCP2P22307 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCP2P22307 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCP2P22307 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCP2P22307 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCP2P22307 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCP2P22307 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCP2P22307 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCP2P22307 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCP2P22307 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCP2P22307 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCP2P22307 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCP2P22307 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCP2P22307 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCP2P22307 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCP2P22307 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCP2P22307 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCP2P22307 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCP2P22307 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCP2P22307 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCP2P22307 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCP2P22307 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCP2P22307 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCP2P22307 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCP2P22307 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCP2P22307 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCP2P22307 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCP2P22307 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCP2P22307 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCP2P22307 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCP2P22307 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCP2P22307 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms