Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRHP20396 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRHP20396 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
TRHP20396 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRHP20396 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRHP20396 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
TRHP20396 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRHP20396 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRHP20396 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TRHP20396 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRHP20396 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
TRHP20396 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRHP20396 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRHP20396 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRHP20396 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRHP20396 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRHP20396 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRHP20396 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRHP20396 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRHP20396 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRHP20396 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRHP20396 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRHP20396 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRHP20396 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRHP20396 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRHP20396 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
TRHP20396 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRHP20396 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRHP20396 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRHP20396 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRHP20396 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRHP20396 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRHP20396 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRHP20396 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRHP20396 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRHP20396 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRHP20396 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRHP20396 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRHP20396 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRHP20396 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRHP20396 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRHP20396 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRHP20396 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRHP20396 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRHP20396 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRHP20396 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRHP20396 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRHP20396 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRHP20396 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRHP20396 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRHP20396 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRHP20396 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRHP20396 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRHP20396 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRHP20396 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRHP20396 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRHP20396 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRHP20396 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRHP20396 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRHP20396 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRHP20396 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRHP20396 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRHP20396 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRHP20396 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRHP20396 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TRHP20396 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRHP20396 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRHP20396 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRHP20396 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRHP20396 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRHP20396 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRHP20396 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRHP20396 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRHP20396 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
TRHP20396 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRHP20396 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRHP20396 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRHP20396 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
TRHP20396 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRHP20396 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
TRHP20396 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
TRHP20396 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
TRHP20396 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRHP20396 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRHP20396 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
TRHP20396 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRHP20396 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRHP20396 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRHP20396 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRHP20396 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRHP20396 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRHP20396 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRHP20396 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRHP20396 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRHP20396 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRHP20396 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRHP20396 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRHP20396 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TRHP20396 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TRHP20396 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms