Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VCAM1P19320 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VCAM1P19320 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VCAM1P19320 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms