Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FLT1P17948 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FLT1P17948 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FLT1P17948 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FLT1P17948 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FLT1P17948 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FLT1P17948 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FLT1P17948 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FLT1P17948 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FLT1P17948 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT1P17948 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT1P17948 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT1P17948 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT1P17948 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT1P17948 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT1P17948 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT1P17948 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT1P17948 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
FLT1P17948 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT1P17948 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT1P17948 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT1P17948 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FLT1P17948 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FLT1P17948 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT1P17948 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT1P17948 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT1P17948 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FLT1P17948 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT1P17948 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT1P17948 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT1P17948 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT1P17948 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT1P17948 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT1P17948 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FLT1P17948 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FLT1P17948 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FLT1P17948 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
FLT1P17948 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FLT1P17948 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FLT1P17948 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT1P17948 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT1P17948 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT1P17948 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT1P17948 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT1P17948 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT1P17948 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT1P17948 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT1P17948 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FLT1P17948 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT1P17948 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT1P17948 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT1P17948 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT1P17948 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT1P17948 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT1P17948 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT1P17948 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FLT1P17948 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FLT1P17948 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FLT1P17948 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FLT1P17948 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FLT1P17948 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FLT1P17948 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FLT1P17948 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FLT1P17948 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FLT1P17948 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FLT1P17948 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FLT1P17948 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
FLT1P17948 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLT1P17948 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLT1P17948 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLT1P17948 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLT1P17948 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FLT1P17948 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FLT1P17948 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FLT1P17948 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FLT1P17948 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FLT1P17948 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FLT1P17948 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FLT1P17948 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FLT1P17948 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FLT1P17948 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms