Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GAP43P17677 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GAP43P17677 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GAP43P17677 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GAP43P17677 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GAP43P17677 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GAP43P17677 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GAP43P17677 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GAP43P17677 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GAP43P17677 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GAP43P17677 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GAP43P17677 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GAP43P17677 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GAP43P17677 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GAP43P17677 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GAP43P17677 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GAP43P17677 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GAP43P17677 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GAP43P17677 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GAP43P17677 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GAP43P17677 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GAP43P17677 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GAP43P17677 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GAP43P17677 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GAP43P17677 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GAP43P17677 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAP43P17677 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAP43P17677 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAP43P17677 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GAP43P17677 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GAP43P17677 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GAP43P17677 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAP43P17677 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAP43P17677 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAP43P17677 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAP43P17677 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAP43P17677 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAP43P17677 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GAP43P17677 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GAP43P17677 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GAP43P17677 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GAP43P17677 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GAP43P17677 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAP43P17677 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAP43P17677 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAP43P17677 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GAP43P17677 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAP43P17677 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAP43P17677 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAP43P17677 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAP43P17677 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GAP43P17677 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GAP43P17677 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAP43P17677 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAP43P17677 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAP43P17677 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAP43P17677 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAP43P17677 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAP43P17677 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAP43P17677 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GAP43P17677 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms