Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKMT2P17540 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKMT2P17540 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKMT2P17540 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms