Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRKCAP17252 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PRKCAP17252 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCAP17252 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCAP17252 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCAP17252 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCAP17252 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCAP17252 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCAP17252 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCAP17252 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRKCAP17252 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCAP17252 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCAP17252 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCAP17252 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCAP17252 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCAP17252 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRKCAP17252 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRKCAP17252 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCAP17252 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCAP17252 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCAP17252 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCAP17252 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCAP17252 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRKCAP17252 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCAP17252 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCAP17252 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRKCAP17252 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCAP17252 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCAP17252 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCAP17252 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCAP17252 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCAP17252 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCAP17252 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCAP17252 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCAP17252 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRKCAP17252 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCAP17252 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCAP17252 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCAP17252 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCAP17252 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCAP17252 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCAP17252 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCAP17252 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCAP17252 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRKCAP17252 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCAP17252 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRKCAP17252 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRKCAP17252 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms