Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAG1P15918 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAG1P15918 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAG1P15918 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAG1P15918 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAG1P15918 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAG1P15918 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAG1P15918 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAG1P15918 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAG1P15918 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAG1P15918 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAG1P15918 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAG1P15918 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAG1P15918 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAG1P15918 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAG1P15918 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAG1P15918 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAG1P15918 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAG1P15918 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAG1P15918 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAG1P15918 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAG1P15918 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAG1P15918 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAG1P15918 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAG1P15918 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAG1P15918 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAG1P15918 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAG1P15918 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAG1P15918 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAG1P15918 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAG1P15918 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG1P15918 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG1P15918 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG1P15918 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG1P15918 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG1P15918 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG1P15918 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG1P15918 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG1P15918 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG1P15918 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAG1P15918 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAG1P15918 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RAG1P15918 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAG1P15918 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAG1P15918 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RAG1P15918 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAG1P15918 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAG1P15918 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAG1P15918 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAG1P15918 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RAG1P15918 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAG1P15918 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAG1P15918 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAG1P15918 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAG1P15918 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAG1P15918 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAG1P15918 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAG1P15918 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAG1P15918 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAG1P15918 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAG1P15918 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAG1P15918 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAG1P15918 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAG1P15918 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAG1P15918 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAG1P15918 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAG1P15918 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAG1P15918 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAG1P15918 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAG1P15918 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAG1P15918 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAG1P15918 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RAG1P15918 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAG1P15918 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAG1P15918 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAG1P15918 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RAG1P15918 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAG1P15918 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAG1P15918 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAG1P15918 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAG1P15918 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAG1P15918 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAG1P15918 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAG1P15918 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAG1P15918 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAG1P15918 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAG1P15918 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAG1P15918 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAG1P15918 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms