Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC5A1P13866 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC5A1P13866 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC5A1P13866 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC5A1P13866 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC5A1P13866 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC5A1P13866 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC5A1P13866 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC5A1P13866 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC5A1P13866 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms