Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCAM1P13591 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCAM1P13591 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCAM1P13591 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAM1P13591 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms