Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CFTRP13569 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CFTRP13569 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CFTRP13569 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CFTRP13569 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CFTRP13569 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CFTRP13569 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
CFTRP13569 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CFTRP13569 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CFTRP13569 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CFTRP13569 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
CFTRP13569 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CFTRP13569 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CFTRP13569 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CFTRP13569 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CFTRP13569 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CFTRP13569 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CFTRP13569 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CFTRP13569 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CFTRP13569 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CFTRP13569 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CFTRP13569 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CFTRP13569 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
CFTRP13569 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFTRP13569 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFTRP13569 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFTRP13569 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFTRP13569 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFTRP13569 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFTRP13569 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
CFTRP13569 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFTRP13569 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CFTRP13569 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CFTRP13569 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CFTRP13569 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CFTRP13569 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
CFTRP13569 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
CFTRP13569 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CFTRP13569 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
CFTRP13569 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CFTRP13569 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CFTRP13569 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CFTRP13569 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CFTRP13569 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CFTRP13569 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CFTRP13569 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CFTRP13569 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
CFTRP13569 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CFTRP13569 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CFTRP13569 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CFTRP13569 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CFTRP13569 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
CFTRP13569 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
CFTRP13569 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CFTRP13569 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CFTRP13569 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CFTRP13569 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CFTRP13569 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CFTRP13569 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CFTRP13569 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CFTRP13569 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CFTRP13569 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CFTRP13569 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
CFTRP13569 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CFTRP13569 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CFTRP13569 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CFTRP13569 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CFTRP13569 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CFTRP13569 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CFTRP13569 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CFTRP13569 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CFTRP13569 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CFTRP13569 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CFTRP13569 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CFTRP13569 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CFTRP13569 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CFTRP13569 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CFTRP13569 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CFTRP13569 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFTRP13569 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFTRP13569 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFTRP13569 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CFTRP13569 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CFTRP13569 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CFTRP13569 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFTRP13569 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFTRP13569 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFTRP13569 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFTRP13569 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFTRP13569 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFTRP13569 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFTRP13569 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFTRP13569 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CFTRP13569 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
CFTRP13569 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CFTRP13569 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CFTRP13569 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms