Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF5P13349 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYF5P13349 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF5P13349 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF5P13349 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYF5P13349 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYF5P13349 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYF5P13349 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYF5P13349 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYF5P13349 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYF5P13349 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYF5P13349 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF5P13349 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF5P13349 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF5P13349 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF5P13349 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF5P13349 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF5P13349 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF5P13349 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF5P13349 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF5P13349 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF5P13349 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF5P13349 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF5P13349 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYF5P13349 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYF5P13349 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF5P13349 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF5P13349 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF5P13349 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MYF5P13349 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MYF5P13349 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF5P13349 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF5P13349 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF5P13349 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF5P13349 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF5P13349 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF5P13349 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF5P13349 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF5P13349 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MYF5P13349 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MYF5P13349 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYF5P13349 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MYF5P13349 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MYF5P13349 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF5P13349 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF5P13349 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF5P13349 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF5P13349 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF5P13349 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF5P13349 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF5P13349 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF5P13349 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYF5P13349 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYF5P13349 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF5P13349 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF5P13349 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF5P13349 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF5P13349 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF5P13349 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF5P13349 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYF5P13349 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms