Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CGB3P0DN86 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CGB3P0DN86 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CGB3P0DN86 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGB3P0DN86 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms