Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMIM13P0DJ93 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM13P0DJ93 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms