Protein–RNA interactions for Protein: P09493

TPM1, Tropomyosin alpha-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM1P09493 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TPM1P09493 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM1P09493 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM1P09493 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM1P09493 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM1P09493 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM1P09493 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM1P09493 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPM1P09493 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM1P09493 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM1P09493 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM1P09493 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM1P09493 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM1P09493 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPM1P09493 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPM1P09493 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM1P09493 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM1P09493 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPM1P09493 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPM1P09493 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPM1P09493 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM1P09493 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM1P09493 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPM1P09493 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM1P09493 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM1P09493 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM1P09493 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM1P09493 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM1P09493 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPM1P09493 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM1P09493 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TPM1P09493 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM1P09493 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM1P09493 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM1P09493 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM1P09493 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM1P09493 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM1P09493 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPM1P09493 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM1P09493 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM1P09493 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM1P09493 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM1P09493 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM1P09493 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPM1P09493 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPM1P09493 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM1P09493 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM1P09493 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM1P09493 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM1P09493 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM1P09493 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPM1P09493 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM1P09493 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM1P09493 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM1P09493 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM1P09493 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms