Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NGFRP08138 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGFRP08138 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGFRP08138 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGFRP08138 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGFRP08138 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGFRP08138 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGFRP08138 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NGFRP08138 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NGFRP08138 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGFRP08138 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NGFRP08138 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NGFRP08138 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NGFRP08138 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NGFRP08138 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NGFRP08138 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NGFRP08138 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NGFRP08138 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NGFRP08138 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NGFRP08138 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NGFRP08138 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NGFRP08138 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NGFRP08138 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NGFRP08138 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NGFRP08138 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NGFRP08138 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NGFRP08138 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NGFRP08138 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NGFRP08138 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NGFRP08138 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NGFRP08138 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NGFRP08138 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NGFRP08138 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NGFRP08138 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NGFRP08138 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NGFRP08138 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NGFRP08138 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NGFRP08138 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NGFRP08138 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NGFRP08138 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NGFRP08138 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NGFRP08138 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NGFRP08138 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NGFRP08138 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NGFRP08138 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NGFRP08138 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NGFRP08138 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NGFRP08138 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NGFRP08138 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NGFRP08138 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms