Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHBGP04278 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHBGP04278 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHBGP04278 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHBGP04278 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHBGP04278 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHBGP04278 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHBGP04278 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHBGP04278 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHBGP04278 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHBGP04278 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SHBGP04278 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHBGP04278 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHBGP04278 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHBGP04278 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHBGP04278 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHBGP04278 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHBGP04278 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHBGP04278 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHBGP04278 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHBGP04278 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHBGP04278 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHBGP04278 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHBGP04278 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHBGP04278 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHBGP04278 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHBGP04278 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHBGP04278 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHBGP04278 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHBGP04278 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHBGP04278 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHBGP04278 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHBGP04278 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SHBGP04278 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SHBGP04278 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHBGP04278 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHBGP04278 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHBGP04278 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHBGP04278 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHBGP04278 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHBGP04278 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHBGP04278 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHBGP04278 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHBGP04278 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHBGP04278 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHBGP04278 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHBGP04278 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHBGP04278 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHBGP04278 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHBGP04278 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHBGP04278 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHBGP04278 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHBGP04278 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHBGP04278 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHBGP04278 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms