Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGBP02675 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FGBP02675 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGBP02675 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGBP02675 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FGBP02675 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGBP02675 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FGBP02675 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGBP02675 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGBP02675 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FGBP02675 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGBP02675 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGBP02675 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGBP02675 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGBP02675 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGBP02675 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FGBP02675 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGBP02675 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGBP02675 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGBP02675 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGBP02675 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGBP02675 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FGBP02675 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGBP02675 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGBP02675 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGBP02675 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FGBP02675 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGBP02675 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGBP02675 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FGBP02675 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGBP02675 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGBP02675 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGBP02675 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FGBP02675 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FGBP02675 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGBP02675 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGBP02675 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGBP02675 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGBP02675 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FGBP02675 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGBP02675 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGBP02675 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGBP02675 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGBP02675 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGBP02675 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FGBP02675 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FGBP02675 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FGBP02675 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FGBP02675 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FGBP02675 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FGBP02675 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGBP02675 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGBP02675 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGBP02675 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGBP02675 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGBP02675 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGBP02675 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms