Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN9O95484 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN9O95484 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms