Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RBBP9O75884 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBBP9O75884 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms