Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNOT3O75175 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms