Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF40O75150 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF40O75150 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF40O75150 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF40O75150 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF40O75150 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF40O75150 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF40O75150 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF40O75150 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF40O75150 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF40O75150 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF40O75150 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF40O75150 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF40O75150 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF40O75150 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF40O75150 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF40O75150 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF40O75150 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF40O75150 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF40O75150 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF40O75150 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF40O75150 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF40O75150 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF40O75150 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF40O75150 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RNF40O75150 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF40O75150 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF40O75150 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF40O75150 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF40O75150 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RNF40O75150 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF40O75150 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF40O75150 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF40O75150 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF40O75150 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF40O75150 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF40O75150 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF40O75150 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF40O75150 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF40O75150 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF40O75150 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF40O75150 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF40O75150 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF40O75150 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF40O75150 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF40O75150 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF40O75150 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF40O75150 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF40O75150 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF40O75150 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RNF40O75150 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF40O75150 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF40O75150 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF40O75150 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF40O75150 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF40O75150 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF40O75150 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF40O75150 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF40O75150 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF40O75150 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms