Protein–RNA interactions for Protein: O43504

LAMTOR5, Ragulator complex protein LAMTOR5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR5O43504 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMTOR5O43504 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMTOR5O43504 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMTOR5O43504 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms