Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB6O15197 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB6O15197 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB6O15197 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms