Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHUKO15111 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHUKO15111 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHUKO15111 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHUKO15111 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHUKO15111 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHUKO15111 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHUKO15111 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHUKO15111 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHUKO15111 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHUKO15111 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHUKO15111 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHUKO15111 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHUKO15111 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHUKO15111 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHUKO15111 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHUKO15111 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHUKO15111 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CHUKO15111 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHUKO15111 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHUKO15111 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHUKO15111 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHUKO15111 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHUKO15111 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHUKO15111 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHUKO15111 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHUKO15111 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHUKO15111 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHUKO15111 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHUKO15111 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHUKO15111 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHUKO15111 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHUKO15111 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHUKO15111 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHUKO15111 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHUKO15111 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHUKO15111 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHUKO15111 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHUKO15111 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHUKO15111 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHUKO15111 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHUKO15111 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHUKO15111 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHUKO15111 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHUKO15111 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHUKO15111 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHUKO15111 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHUKO15111 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHUKO15111 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHUKO15111 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHUKO15111 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHUKO15111 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHUKO15111 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHUKO15111 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHUKO15111 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHUKO15111 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHUKO15111 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHUKO15111 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHUKO15111 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CHUKO15111 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHUKO15111 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHUKO15111 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHUKO15111 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHUKO15111 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHUKO15111 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHUKO15111 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHUKO15111 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHUKO15111 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHUKO15111 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHUKO15111 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHUKO15111 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms