Protein–RNA interactions for Protein: O14939

PLD2, Phospholipase D2, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD2O14939 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PLD2O14939 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLD2O14939 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PLD2O14939 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLD2O14939 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLD2O14939 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLD2O14939 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLD2O14939 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLD2O14939 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLD2O14939 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PLD2O14939 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PLD2O14939 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLD2O14939 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLD2O14939 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PLD2O14939 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLD2O14939 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PLD2O14939 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLD2O14939 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLD2O14939 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLD2O14939 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PLD2O14939 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLD2O14939 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PLD2O14939 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLD2O14939 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLD2O14939 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLD2O14939 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLD2O14939 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLD2O14939 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLD2O14939 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLD2O14939 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLD2O14939 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLD2O14939 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLD2O14939 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLD2O14939 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLD2O14939 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLD2O14939 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLD2O14939 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLD2O14939 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLD2O14939 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLD2O14939 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLD2O14939 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLD2O14939 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLD2O14939 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLD2O14939 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLD2O14939 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLD2O14939 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLD2O14939 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLD2O14939 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLD2O14939 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLD2O14939 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLD2O14939 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLD2O14939 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLD2O14939 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLD2O14939 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLD2O14939 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLD2O14939 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLD2O14939 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLD2O14939 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLD2O14939 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms