Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PHOX2AO14813 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PHOX2AO14813 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PHOX2AO14813 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms