Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA4O00629 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA4O00629 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA4O00629 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA4O00629 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA4O00629 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA4O00629 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA4O00629 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA4O00629 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA4O00629 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KPNA4O00629 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KPNA4O00629 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms