Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CDO00329 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CDO00329 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CDO00329 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CDO00329 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CDO00329 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3CDO00329 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3CDO00329 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3CDO00329 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms