Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
CCER2I3L3R5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCER2I3L3R5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCER2I3L3R5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms