Protein–RNA interactions for Protein: A0PK00

TMEM120B, Transmembrane protein 120B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM120BA0PK00 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM120BA0PK00 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM120BA0PK00 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM120BA0PK00 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms