Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A0A0B4J203 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0B4J203 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A0A0B4J203 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms