Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms