Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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