Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEU3Q9UQ49 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms