Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms