Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH4Q9P2E8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms