Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HCN3Q9P1Z3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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