Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USP29Q9HBJ7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
USP29Q9HBJ7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms